Quizás sea más justo que el método español pero tampoco es un buen método. Si hay separación entre religiones y estado no sé qué pinta este último haciendo de recaudador para las primeras. Las Iglesias deberían buscarse por ellas mismas su manera de financiarse, ya sea con donativos, con actividades económicas, ambas... Además me resulta chocante que el estado te pregunte tu fe y en base a eso te obligue a pagar una cantidad determinada o no. El estado debería tener prohibido preguntar las creencias religiosas de sus ciudadanos.
Por cierto, si te referías a Alemania, además del impuesto de la iglesia el estado también ayuda a las Iglesias con cierta financiación.